• Santé et Nutrition

BioImaging Center Lille (BICeL)

Plateforme

BioImaging Center Lille

Description

Membre des plateformes Lilloises en Biologie Santé (UAR 2014 US 41 PLBS), le BioImaging Center Lille (BICeL) est la plateforme académique d’imagerie photonique, d’histologie, d’imagerie électronique et de cytométrie en flux de la métropole Lilloise. Il présente une structuration multi-sites (le campus santé (SA), la cité scientifique (CS) et l’Institut Pasteur de Lille (IPL)) et multi-technologies regroupant 20 personnes.

BICeL soutient la recherche locale, nationale et internationale, offrant des technologies avancées au service des problématiques en biologie et santé. Il rend accessible un parc de 38 équipements, notamment d’imagerie multi-modale pour l’analyse de phénomènes biologiques complexes en temps réel. Ces outils sont utilisés sur un large panel d’échantillons, allant des micro et nano-particules, bactéries, mollusques, insectes, poissons jusqu’aux mammifères (dont prélèvements de patients), en conditions de sécurité biologique adéquates (infectieuses ou non). L’expertise au sein du BICeL permet un accompagnement individualisé, du conseil à la prestation complète.

Contacts

  • Nathalie Jouy
    Responsable technique
  • Frank Lafont
    Directeur de recherches
  • Sophie Salomé-Desnoulez
    Responsable technique
  • Meryem Tardivel
    Responsable technique

Informations

1 rue du professeur Calmette
59019 LILLE

https://ums-plbs.univ-lille.fr/les-plateformes-constitutives/imagerie-cellulaire

Chiffres clés

• >415 utilisateurs/an
• >15 publications/an
• >130 projets actif/an dont 7% de projets industriels
• 102 publication sur la période 2020-2023

Expertises

Compétences

• Imagerie électronique à transmission (MET) et balayage (MEB), incluant la (cryo-)tomographie en MET et SEM et l’analyse EDX et EELS en MET
• Microscopie photonique (FRAP, FRET, STED) en milieu de confinement
• Cytométrie conventionnelle et spectrale, imagerie en flux et tri cellulaire, y compris en milieu de confinement
• Préparation des échantillons pour la microscopie électronique, pour l'histologie, pour l'imagerie de fluorescence
• Analyse et l’interprétation des données
• Analyse d'images
• Imagerie cellulaire, tissulaire et intravitale haute résolution du petit animal

Exemple(s) de projets

Hepatitis C virus alters the morphology and function of peroxisomes.
Front Microbiol; DOI: 10.3389/fmicb.2023.1254728

Amoxicillin treatment of pneumococcal pneumonia impacts bone marrow neutrophil maturation and function.
J Leukoc Biol 2024; DOI: 10.1093/jleuko/qiad125

REPRISAL: mapping lignification dynamics using chemistry, data segmentation, and ratiometric analysis.
Plant Physiol 2022; DOI: 10.1093/plphys/kiab490

Persistence and dynamics of fluorescent Lactobacillus plantarum in the healthy versus inflamed gut.
Gut Microbes 2021 ; DOI: 10.1080/19490976.2021.1897374

Hydrophobicity of abiotic surfaces governs droplets deposition and evaporation patterns.
Food Microbiol 2020 DOI: 10.1016/j.fm.2020.103538

Collaborations/Partenaires/Clients scientifiques

Nationaux:
Université de Rouen, Institut Curie, Institut Pasteur Paris, Institut Cochin, Université de Technologie de Compiègne, Université de Toulouse, Sorbonne Université, ANSES

Internationaux:
Institut Weizmann pour les Sciences (Israël), Université Libre de Bruxelles (Belgique)

Offres de services

Secteurs d'applications

  • Biotechnologies
  • Santé / Bien-être
  • Recherche / Science

Prestations de service

• Imagerie photonique, incluant l’imagerie in vivo en animalerie A2, la haute et super-résolution, les méthodologies FRAP, FRET et feuille de lumière
• Imagerie électronique à transmission (MET) et balayage (MEB), incluant la (cryo-)tomographie
• Assistance à la préparation des échantillons et le choix du système approprié à la problématique scientifique
• Aide au design, à l’acquisition et à l'analyse de données
• Prise en charge de toute ou partie d’un projet d’étude (préparation, immuno-marquages, acquisition, analyse des données) dans le cadre des prestations de service
• Prestation en restauration d’images par déconvolution 3D
• Accès aux outils de data management pour les échanges entre collaborateurs

Offres de formations

Nous proposons des formations théorique et pratique aux techniques spécifiques à différents niveaux (formation initiale, formation continue, formation utilisateur BICeL):
• Bases théoriques de la cytométrie
• Pratique en cytométrie
• Pratique en microscopie électronique
• Théorie et pratique en microscopie photonique
• Analyse d'images
• Videomicroscopie
• Transparisation et imagerie 3D

Prestations de conseil

Prestations de conseil sur l'ensemble de nos compétences

Equipements

La plateforme BICeL est équipée d’instruments de pointe en microscopie électronique, photonique, histologie et imagerie en flux :
• microscopes électroniques
• microscopes à haut contenu
• microscopes photoniques (confocaux LSM et spinning disk, STED, multiphotons, vidéomicroscopes, microscopes à épifluorescence, microscope à feuille de lumière, scanner de lames)
• Microtome et station d’enrobage pour l'histologie
• Imageur en flux
• Trieus et analyseurs (analyseur spectrale et accoustique)
• ultramicrotomes et cryo-ultramicrotomes
• appareils de cryo-fixation et cruo-substitution

Découvrez la liste détaillée des équipements :
https://bicel.univ-lille.fr/
https://www.ibisa.net/plateformes/

Equipements

Nom Modèle Marque
Ultramicrotome Ultracut R/ Leica
Microscope électronique en transmission JEM 2100/ JEOL
Microscope électronique à balayage Merlin Compact VP/ Zeiss
Microscope confocal LSM 780 fast Airy scan/ Zeiss
Cytométre en flux LSR Fortessa X20/ BD
Microscope à feuille de lumière Ultramicroscope/ Lavision
Microscope vidéo rapide SD live SR/ Nikon Roper
Microscopie bi-photon SP8/ Leica

Écosystème

Établissements / Organismes de rattachement

Université de Lille
CHU de Lille
Inserm
CNRS
Institut Pasteur de Lille

Unité(s) de rattachement

Groupements/Réseaux/Fédérations

Labellisations

Domaines d'activités stratégiques régionales

  • Santé et Nutrition
    • Génétique, bio-marqueurs et biomolécules